Es aquél en el que se reúne la documentación en trámite o sometida a continua utilización y consulta administrativa por la unidad productora. Hay archivos de gestión en todas las unidades de la Universidad de Valladolid, tanto las docentes como las administrativas.

Es aquél al que se transfieren, de acuerdo con un calendario previamente establecido, los documentos de los diferentes archivos de gestión cuando su consulta por los centros productores resulta esporádica. Permanecen en él hasta su eliminación, si así se decide cumpliendo la legislación vigente, o transferencia al archivo histórico. Dispone de un inventario automatizado.

Está dedicado a conservar permanentemente la documentación, tanto la que ya custodia como la que va recibiendo por transferencias del archivo intermedio. En el archivo histórico se atienden las consultas de los investigadores.

Cuenta con documentación desde el siglo XI relativa a asuntos académicos, económicos y judiciales de la Universidad de Valladolid y su distrito. Está disponible un inventario para uso público. Así mismo, se puede consultar la relación de todos los graduados (bachilleres y licenciados) por la Universidad de Valladolid desde el siglo XVI hasta 1936.