La biblioteca posee los siguientes catálogos publicados sobre nuestros fondos:
·GUTIERREZ DEL CAÑO, Marcelino: "Códices y manuscritos que se conservan en la biblioteca de la Universidad de Valladolid". - Valladolid, 1888.
·RIVERA MANESCAU, Saturnino y ORTEGA LAMADRID, Paulino: "Catálogo de manuscritos de la Biblioteca Universitaria y de Santa Cruz de Valladolid". - Valladolid, 1929-1935. Publicado en la Revista "Anales de la Universidad de Valladolid" durante estos años.
·ALONSO CORTES, María de las Nieves: "Catálogo de Manuscritos de la Biblioteca de Santa Cruz". - Valladolid, Universidad, 1976.
·RIVERA MANESCAU, Saturnino: "Papeles pertenecientes al Colegio Mayor de Santa Cruz". - Valladolid, 1918.
·RIVERA MANESCAU, Saturnino: "Catálogo de la Biblioteca Universitaria y Provincial (Santa Cruz): Incunables y Raros". - Valladolid, 1918.
·Aunque no contamos con otro catálogo de Incunables propio actualizado, los fondos son conocidos y han sido estudiados en repetidas ocasiones, como lo demuestra su inclusión en los dos catálogos colectivos nacionales existentes hoy:
·"CATÁLOGO colectivo de incunables existentes en las bibliotecas españolas". - Ed. provisional. - Madrid, 1970-71.
·"CATÁLOGO general de incunables en bibliotecas españolas" / coord. y dirigido por Francisco García Cravioto. 2 vols. - Madrid: direccion General del Libro y Bibliotecas, 1989-1991.
Catálogos publicados con motivo de la Fiesta del Libro y otros acontecimientos universitarios. Durante los años 1944 y 1987 se celebraron cerca de 26 exposiciones bibliográficas de fondos de Santa Cruz, sobre diversas materias que van desde manuscritos e incunables, hasta temas monográficos sobre Teología, Derecho, Historia de España, Literatura, etc. de todos los cuales se han ido publicando catálogos en su momento.
Conviene destacar tres obras, verdaderos estudios sobre las materias tratadas, de los libros que componen esta sección:
·GARCIA DEL CARRIZO SAN MILLAN, María Gloria: "Obras de interés médico y científico en las bibliotecas universitarias y de Santa Cruz de Valladolid (hasta 1877)". - Valladolid: Universidad, 198
·GARCÍA VEGA, Blanca: "El grabado del libro español: Siglos XV-XVII" (aportación a su estudio con los fondos de las bibliotecas de Valladolid). - Valladolid: Institución Cultural Simancas, 1984. 2 vols.
·"FUENTES para la historia de la ciencia y la técnica en la Biblioteca del Palacio de Santa Cruz" / Mariano Esteban Piñeiro [et al. - Valladolid: Junta de Castilla y León, 1990.